В 1903 году Кристиан Мортенсен перебрался в Соединённые Штаты, где неоднократно менял место жительства и род занятий — в частности, трудился молочником и рабочим на консервной фабрике. У себя на родине, в Дании, он был занят в сельском хозяйстве и осваивал портновское ремесло. Недолгое время состоял в браке, однако союз не сложился, и потомства Мортенсен не оставил. В дальнейшем он избегал серьёзных отношений с женщинами. Порой позволял себе выкурить сигару, полагая, что умеренное курение не причиняет значительного вреда. Кристиан отдавал предпочтение рыбе и мясу птицы, но старался не есть красное мясо. Жажду утолял исключительно кипячёной водой.

В 1973 году Кристиан Мортенсен самостоятельно добрался до дома престарелых «Aldersly Retirement Community» в городе Сан-Рафаэль (вблизи Сан-Франциско) и объявил сотрудникам, что желает остаться. Там и прошли заключительные 25 лет его жизни.

В преклонные годы Мортенсен почти полностью утратил зрение и бо́льшую часть времени проводил в инвалидной коляске, слушая радио. К моменту его смерти в живых не осталось никого из его родных.

Кристиан Мортенсен скончался 25 апреля 1998 года, прожив 115 лет и 252 дня.